撤系建院后，目前机电工程学院下设机械设计及其自动化、热能与动力工程、机械制造及其自动化和机械电子与测控四个系，工程力学及材料、工程图学和工程实验三个中心。为了贯彻落实9月份与学校签定的三年任期目标，该院与系、中心通过签定目标责任书的方式实行目标管理，对学校三年任期目标的指标进行分解，从而激发广大教职工的主人翁意识和责任意识，充分挖掘潜力，统一协调、分工负责，推进机电工程学院各项工作的稳步开展。